分子診斷所應用到的分子生物學技術主要包括，聚合鏈式反應（PCR），熒光定量PCR（qPCR），DNA測序（DNA Sequencing），熒光原位雜交（FISH），DNA印記技術（DNA Blotting），單核酸多態性（SNP）和基因芯片（Gene Chip）等技術。這些技術的操作都離不開一個重要的物質 – 核酸（DNA和RNA）。而由于日常檢測中要處理大量的不同來源的核酸以及核酸本身難以降解的特性，核酸污染是困擾絕大多實驗室的一個難題。微量的核酸污染會產生假陽性的檢測結果，這樣會對病人造成誤診，耽誤病情。如任由此情況發展，會形成氣溶膠污染而擴散，會導致整個實驗室的污染，嚴重的會關閉實驗室，如無備用實驗室，會造成更大的損失。

在與核酸污染長期抗爭中，人們也總結出了一些預防和清除核酸污染的方法。對于預防，實驗人員一定要不斷改進并嚴格遵循實驗室操作流程，對實驗室不同操作進行區域劃分，分裝試劑，定期對實驗儀器進行滅菌，實驗室適當通風，養成實驗中進行陰陽對照的好習慣。當污染已經出現，傳統的清除方法包括對可疑器用稀酸進行擦拭或浸泡，紫外線照射，對反應液用DNaseⅠ或內切酶進行處理等方法。這些方法對一些微量污染會有一定效果，但對污染效果不是很理想，而且紫外線照射會對人體造成一定的危害。近些年來，一些生物試劑公司專門開發研制出一些檢測清除核酸污染的試劑，這些試劑具有對人體無害，操作簡單，省時等特點，其中一些試劑只需噴灑在污染去經過一段時間的反應，擦除后便可清除污染。但這些產品還是相對傳統方法花費略高。

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